性交渉によるカンジダ菌の感染は少ないといわれていますが、免疫力が低下しているときはまれに感染することがあり、その確率はおよそ5～10％といわれています。特に、性器カンジダ症を患っているときに性交渉を行うと、感染しやすいとされています。
男性の場合は性器がむきだしになっているので、性交渉後にシャワーなどでしっかり洗い落せば、ほとんどの場合に感染することはないそうですが、包茎の人は洗い落とすのが難しくなることから、感染に至る場合もあると言います。